donmigel_62: (кот - учёный)

Созданы крошечные биороботы, способные самостоятельно передвигаться в водной среде

Биоробот


Таинственный мир микроорганизмов, живущих в водной среде, недавно пополнился еще одним видом обитателей - синтетическими биороботами, способными к самостоятельному передвижению. Эти биороботы, разработанные группой исследователей из университета Иллинойса, возглавляемой профессором Тахером Сэйфом (Taher Saif), плавают при помощи движений своего длинного хвоста, подобно тому, как передвигаются сперматозоиды, и, благодаря этому, могут перемещаться не только в воде, но и в любой жидкости, имеющей достаточно высокое значение плотности и вязкости.



"В распоряжении микроорганизмов имеется целый свой мир, на который мы можем взглянуть только через микроскоп" - рассказывает профессор Тахер Сэйф, - "Теперь, благодаря нашим биороботам, мы не только можем наблюдать за этим микромиром, но и оказывать влияние на происходящие там события. И это является первым случаем в истории науки, когда специально спроектированная синтетическая система сможет выполнять набор определенных действий в мире микроорганизмов".

Структура биороботов является почти точной копией строения жгутиковых микроорганизмов, микроорганизмов, имеющих длинные "хвосты" за счет которых они передвигаются в жидкой окружающей среде. Создание биоробота начинается с изготовления частей его тела из гибкого полимерного материала. Тело и жгутик биоробота создаются по отдельности и затем скрепляются при помощи определенного не очень сложного метода.

Биоробот и микроорганизм


Но самый главный фокус заключается в том, что затем в точке сочленения тела биоробота и его жгутика выращивается колония клеток ткани сердечной мышцы. По мере роста эти клетки самовыравниваются, синхронизируются и при достижении этой "колонией" определенной величины они начинают самопроизвольно сокращаться. Сокращение этих клеток приводит к изгибанию тонкого жгутика, который начинает совершать поступательные движения, которые толкают вперед всего биоробота. Максимальная скорость, которую может развить такой биоробот в воде, составляет 81 микрон в секунду.

Исследовательская группа также создала "двухсторонних" биороботов, на жгутиках которых выращены две колонии клеток сердечной мышцы с разных сторон и на определенном расстоянии друг от друга. Мощность такого "биодвигателя" существенно больше мощности одной колонии клеток, что позволяет биороботу передвигаться с более высокой скоростью. Также исследователи работают в направлении создания биороботов, имеющих несколько жгутиков, и если будут найдены способы управления движениями отдельно взятых жгутиков, то такие биороботы смогут не только двигаться в одном направлении, но и совершать сложные маневры, что обеспечит им широкую область применения в медицине, биомедицине и в экологическом контроле.

http://www.tgdaily.com/general-sciences-features/85991-tiny-swimming-bio-bots-boldly-go-where-no-bot-has-swum-before
donmigel_62: (кот - учёный)

Биокомпьютер решает, когда вводить лекарства


Система отвечает только на определенные комбинации биомолекулярных сигналов.

Система отвечает только на определенные комбинации биомолекулярных сигналов.

Американские исследователи разработали ферментативную логическую систему, которая в перспективе может найти применение для высвобождения лекарств. Представленная работа является первой искусственной биомолекулярной системой, которая может обрабатывать серии физиологических сигналов без применения электроники [1].

Логическая система, основанная на биокомпьютере и обрабатывающая биомолекулярные сигналы, могла бы кардинально изменить доставку лекарственного препарата в организм. С использованием поверхности чувствительных электродов, реагирующих на определенные биохимические импульсы, персонификация терапевтического подхода «под конкретного пациента» становится все ближе к реальной действительности.

Недостатком систем, высвобождающих лекарства, являлось медленное и бесконтрольное высвобождение фармацевтически активного компонента. Для того, чтобы простимулировать высвобождение лекарственного препарата использовались различные внешние факторы воздействия, включая температуру, pH и биологически активные вещества.


Системы, активирующиеся биохимическими сигналами, часто являются сложными и ограниченными в применении из-за того, что для их работы необходимо сочетание как рецептора, так и системы высвобождения лекарства. Физическое разделение этих двух компонентов на отдельных электродах смогло бы упростить процесс.

Дополнив свою последнюю работу [2] электродами, чувствительными к глюкозе, Евгений Кац (Evgeny Katz) и Шей Мэйлокс (Shay Mailloux) из Университета Кларксон при сотрудничестве с Жаном Халамек (Jan Halámek) из Университета Нью-Йорка в Олбани разработали логическую биомолекулярную систему высвобождения фармацевтически активного компонента. Электрод, покрытый редокс-активной полимерной пленкой альгината, поперечно сшитой ионами железа(III) и содержащей механически связанные биомолекулы, выполняет функцию элемента, высвобождающего лекарственное вещество, а электрод, модифицированный пирролохинолинхиноном [pyrroloquinoline quinone (PQQ)], выступает в качестве биокаталитического электрода.

Система отличается высокой селективностью, поскольку она реагирует только на специфические комбинации биомолекулярных возбуждающих сигналов, которые обрабатываются тщательно разработанной системой последовательно расположенных логических элементов – затворов. В результате окисления NADH биокаталитический электрод генерирует отрицательный потенциал и ток восстановления. В свою очередь, ионы железа (III) восстанавливаются до железа(II), пленка становится растворимой и инкапсулированные в ней биомолекулы высвобождаются. Использование NADH для инициирования высвобождения является важным достижением, поскольку NADH может быть сгенерирован многочисленными биокаталитическими системами организма, а это позволяет расширить применение разработанной модельной системы.

Евгений Кац говорит, что новизна представленного подхода заключается в высвобождении целевой молекулы при получении определенных сигналов, которые в итоге могли бы быть сигналами, получаемыми от тела пациента.

Он подчеркивает, что эта работа впервые представляет систему объединяющую биологические вычисления с высвобождением биомолекулы.

Кац поясняет, что исследование демонстрирует применение биологических вычислений, иными словами обработки данных с помощью биохимических способов, для инициирования последующего процесса. Такой процесс мог бы сравниться с соединением компьютера с принтером. В таком сочетании компьютер обрабатывает информацию, а принтер печатает данные. По существу, разработанная исследователями биохимическая система работает именно таким образом.

Э Празанна де Силва (A Prasanna de Silva), эксперт по квантовой химии из Королевского университета Белфаста в Великобритании, описывает систему как редкий образец логического высвобождения лекарства. Ему вторит Энди Адамацки (Andy Adamatzky) из Университета Западной Англии в Великобритании, говоря, что

проведенное учеными исследование открыло новые области применения для вновь появляющихся моделей расчетов. Исследователи смогли перенести необычные способы вычислений из исключительно теоретической области в живую прикладную сферу, где представления о необычной обработке данных и принятие решения могут осуществляться с участием биомолекул и, в перспективе, применяться для лечения заболеваний.

Хотя представленная исследователями концепция еще не готова для полноценного медицинского применения, работа над повышением ее практичности уже находится на пути реализации, Исследователи для осуществления поставленной задачи пытаются использовать настоящие биологические жидкости.

Источники:

[1] Analyst, 2014, DOI: 101.1039/c3an02162a;

[2] Chem. Commun., 2013, 49, 4755 (DOI: 10.1039/c3cc42027b).

donmigel_62: (кот - учёный)

Ученые разработали специальный язык для программирования процессов создания синтетической ДНК

Химический компьютер


Подобно тому, как с помощью языков C, Python и Java пишутся программы для компьютеров, ученые-химики и биохимики с помощью набора специальных структурированных инструкций скоро будут в состоянии программировать процессы, происходящие в пробирках или живых клетках, в которых принимают участие молекулы синтетической ДНК. Ученые из Вашингтонского университета, разработавшие специальный язык программирования химических реакций, надеются, что с его помощью процессы по формированию сложнейших соединений, таких, как молекулы ДНК с заранее заданной структурой, упростятся до уровня, на котором программируются алгоритмы управления роботами, промышленными установками и прочими исполнительными устройствами. Помимо биохимии, новый вид "химического" программирования наверняка найдет весьма широкое применение в медицине и фармакологии.

Ученые-химики и преподаватели учебных заведений в своей работе для описания химических реакций пользуются языком химических уравнений, который известен людям уже почти две сотни лет и который описывает последовательность химических превращений. Ученые из Вашингтона взяли за основу язык химических формул и расширили его, превратив его не просто в описание реакций, а в последовательность кодов и необходимых оперативных данных для химического оборудования, которое будет выполнять синтез молекул и соединений.

"Мы начинаем программу с абстрактного математического описания используемой химической системы, а затем, используя специально подготовленную ДНК, мы начинаем буквально выстраивать сложнейшие молекулы, которые имеют необходимую нам структуру и свойства" - рассказывает Георг Зеелиг (Georg Seelig), ученый из Вашингтонского университета, принимавший участие в создании языка химического программирования, - "Используя такую технологию и специализированное химическое оборудование общего назначения, можно синтезировать практически любое вещество".

Элементы химической программы


В настоящее время процесс создания "сетей" из молекул определенных типов является чрезвычайно сложным процессом, требующим тщательной подготовки и скрупулезного исполнения. Новый язык программирования сделает достаточно простой реализацию первой части задачи, а выполнение второго этапа возьмет на себя компьютер, связанный с исполнительными органами химического лабораторного или промышленного оборудования. "Наш подход дает ученым в руки очень большую гибкость. Обычно, если вам требуется что-либо изменить в компьютерных расчетах, вы изменяете программу и запускаете ее снова. Точно также происходит и в случае "химического" программирования, меняя базовый набор программ, можно добиться синтеза крайне широкого ряда органически и неорганических веществ, молекулы которых будут иметь заранее заданную пространственную структуру" - рассказывает Георг Зеелиг.

Новая технология "химического" программирования, к сожалению, пока еще не готова к началу ее практического использования. Помимо собственно языка программирования, который уже разработан, ученым потребуется разработать массу химического оборудования, которое под управлением компьютера будет в состоянии выполнять команды запущенной "химической" программы, своего рода универсальный химический процессор. А с помощью достаточно примитивной лабораторной установки, имеющейся в распоряжении Вашингтонских ученых, в качестве примера им удалось спроектировать и создать некоторые виды синтетических биологических систем, точнее, сложнейших молекул, которые ведут себя точно также, как и их аналоги естественного происхождения.
donmigel_62: (кот - учёный)

Генетическое конструирование развивается быстрее электроники.

Фото: Science

Уже через несколько лет получить живой организм с заданными свойствами можно будет также просто, как сегодня сделать покупку в магазине приложений. Причем свойства этих организмов будут совершенно необычными, несвойственными живой природе.

Целый ряд стартапов уже работает над тем, чтобы в ближайшем будущем создание новых форм жизни проходило так же просто, как создание цифрового изображения, распечатанного на принтере. И это будущее, в котором ДНК можно будет проектировать на компьютере и отправлять в печать в специальную биоустановку, уже не за горами.

Компания Genome Compiler, название которой — «Компилятор генома» — говорит само за себя, основана выпускником Стэнфорда Омри Амирав-Дрори (Omri Amirav-Drory). Предприятие занимается разработкой методики конструирования ДНК. Фирма получила первичное финансирование на Кикстартере, однако теперь ей помогают такие гиганты, как Autodesk.

«Мы демократизируем акт творения, — говорит Омри, рассказывая о миссии своей компании. — ДНК является просто разновидностью кода, в котором можно сделать исправления так же, как это можно сделать в обычном программном коде». Глава компании добавляет, что суть методики заключается в использовании фрагментов ДНК растений и животных в качестве элементов конструктора, из которых можно создать новые организмы.

Омри допускает, что в будущем можно будет создать что-то вроде магазина приложений, в котором любой желающий может скачать код для создания необходимого живого организма. Причем, эти организмы cмогут обладать свойствами, которые не присущи организмам естественного происхождения.



Но нужную последовательность генов мало смоделировать. Нужно еще собрать ее, или хотя бы уметь внести в существующий геном требуемые изменения. Для этого ученые продолжают работать над совершенствованием старых методов, таких как полимеразная цепная реакция (реплицирование ДНК), а также работать над новыми методиками, такими как лазерное катапультирование.

Но даже самих ученых поражает скорость, с которой развиваются биоинженерные технологии. «Секвенирование генома человека завершилось 10 лет назад, — рассказывает Омри, — оно обошлось в $3 миллиарда и заняло 15 лет. Теперь это можно сделать за несколько тысяч долларов и один день». Ученый привел пример, как за пару лет стоимость реплицирования пары ДНК снизилась с $2 до $0,25, пояснив, что биоинженерия развивается намного стремительнее микроэлектроники. Просто обычным людям прогресс в этой области не настолько очевиден.

http://www.genomecompiler.com/

donmigel_62: (кот - учёный)

Быстрая и простая генная инженерия: можно изменить ДНК за 1 шаг

В издании ACS Synthetic Biology опубликовали новость об эксперименте, который открывает новый простой путь для создания искусственных и генно-модифицированных организмов.

Новая технология, названная clonetegration, позволяет проводить модификацию ДНК за один прием, что облегчает и ускоряет работу генного инженера.


Принцип работы технологии clonetegration

Интеграция куска ДНК в геном бактерии является главным инструментом генной инженерии, которая изготавливает специальных бактерий для различного применения, например выработки биотоплива из отходов или очистки разливов нефти. К сожалению, современные методы генной инженерии очень трудоемкие, включают много этапов, да к тому же имеют множество ограничений в плане возможностей «переделки» организмов и тем более создания новых. Для устранения этих проблем, группа исследователей во главе с Китом Шервином разработала новую технологию clonetegration, которая основана на клонировании генов или фрагментов ДНК.

Новая технология позволяет внедрять фрагменты ДНК всего лишь за один шаг, что выгодно отличает ее от любых других современных методик. В ходе лабораторных испытаний технологии clonetegration, ученые осуществляли успешнее модификации бактерий E.coli и Salmonella Typhimurium, которые широко используются в биотехнологиях. Новый метод генной инженерии очень быстр, эффективен и позволяет интегрировать в геном несколько генов одновременно, что позволяет эффективно создавать синтетические биологические системы.

donmigel_62: (кот - учёный)

Известный генетик Крейг Вентер рассказал о пересылке вакцин по электронной почте


Известный генетик Крейг Вентер рассказал о создании «телепортера» — конвертера, способного переводить биологическую информацию в цифровую, а также устройства, превращающего эту информацию в живую молекулу, и предложил отправить это устройство на Марс.

Крейг Вентер, генетик, первым прочитавший геном человека, обогнав при этом громадный международный консорциум, а два года назад синтезировавший бактерию с искусственной ДНК, снова удивил мир (статья в gazeta.ru от 24.10.2012; NNN). Выступая на прошлой неделе в Нью-Йорке с докладом на конференции Wired Health , он шокировал собравшихся предложением послать на Марс секвенирующую машину .

Вентер верит в то, что на Марсе есть жизнь, и в то, что эта жизнь обязательно будет найдена. Он предлагает секвенировать геном марсианской бактерии, когда ее обнаружат, послать ее цифровую копию на Землю, а здесь воссоздать ее с помощью 3D-принтера.

Многим из собравшихся показалось, что это немножко слишком даже для Вентера, но, поскольку для этого человека слова «слишком», похоже, не существует, только и остается ждать, когда на Марсе найдут бактерию.

Марсианский прожект «геномного колдуна» несколько заслонил собой идею, лежащую в его основе, которая, кстати сказать, реализуется, по словам Вентера, уже прямо сейчас.

Он и его коллеги называют эту концепцию «биологической телепортацией». Как заявил генетик, он и его команда в созданном им Институте имени Крейга Вентера работают над созданием «телепортера» — биологического конвертера, способного переводить биологическую информацию в цифровую, а также устройства, превращающего эту информацию в живую молекулу.



«Это 3D-принтер для ДНК, 3D-принтер для жизни, — говорит Вентер. — Это способ переносить белки, вирусы, отдельные человеческие клетки со скоростью света. Мы нашли способ оцифровать биологический объект, послать его в нужное место, а там реконструировать заново».


Возможно, идея биологической телепортации пришла к нему в 2009 году во время вспышки свиного гриппа в Мехико-Сити. Его команда пыталась создать вакцину против вируса H1N1, но потеряла много времени, поскольку власти запретили тогда посылку вируса из города.



«Если бы мы могли тогда оцифровать вирус, — говорит Вентер, — мы могли бы послать его куда угодно простой электронной почтой».





В идеале процедура биологической телепортации выглядит просто: телепортер оцифровывает, скажем, вакцину, пересылает ее цифровую копию по электронной почте, а там эту информацию закладывают в биопринтер, на выходе которого снова вакцина. Даже сегодня, не имея на руках биопринтера, можно с помощью этой процедуры существенно ускорить процесс создания вакцины и таким образом сохранить множество жизней.

У идеи много противников, выдвигающих два серьезных возражения.

Первое — пересылать можно не только лекарства, но и смертоносные вирусы, например, вирус лихорадки Эбола, поэтому нужны особые меры предосторожности и защиты от смертельного спама. Во-вторых, белок, вирус или другой биообъект в цифровом виде чрезвычайно хрупки: лишняя или случайно выпавшая единичка в цепочке цифр может привести к тому, что, будучи перепечатан на биопринтере после пересылки, он уже не будет функционировать.

Но даже противники признают, что биологическая телепортация способна кардинально изменить современную медицину.

Конечно, вряд ли Вентер получит за какое-то из своих открытий Нобелевскую премию. Однажды, щелкнув мировое научное сообщество по носу, он сумел заслужить со стороны коллег гигантское уважение, но, тем не менее, это прежний «анфан террибль», а таким медалей не выдают.

Если у человека случается минута всемирной славы, то он знает, что больше таких минут в его жизни не будет. Вентер же эти моменты словно коллекционирует.

Ветеран войны во Вьетнаме (он там был медиком), затем студент на грани отчисления, плейбой, любитель виндсерфинга, затем вдруг генетик, которому отказывают в финансировании для участия в программе «Геном человека». После пары безуспешных попыток получить грант он плюет на всякую государственную поддержку и становится генетиком, «который бродит сам по себе». Став таким бродячим генетиком, что само по себе феномен в современном научном мире, он быстро находит инвесторов, проводит несколько блестящих исследований, основывает компанию «Селера» и бросает перчатку фактически всему этому миру со словами «Я первым расшифрую геном человека!».

Свое обещание он выполнил.

Дальше начинаются скандалы. Сначала скандал со всем миром, когда он не желает отдавать свое открытие даром (ведь затрачены деньги!), потом скандал с собственной компанией. Разругавшись с собственным директоратом (что-то там не очень внятное вокруг генома мыши), он покидает «Селеру», и о ней больше никто не слышит.

Казалось бы, и Вентера ждет та же судьба: Крейг сделал свое дело — Крейг может уйти. Не тут-то было. Он организует свой собственный институт, который тут же начинает будоражить мир результатами своих генетических изысканий. Сначала эти результаты не идут ни в какое сравнение с расшифровкой человеческого генома (так, он расшифровал геном собственного пса), затем они становятся посерьезнее и заканчиваются созданием бактерии с искусственно созданной ДНК.

Теперь Вентер снова удивил коллег. Но, похоже, они удивились бы куда больше, если бы он перестал это делать.

Автор: Владимир Покровский
donmigel_62: (кот - учёный)
Три года после создания синтетической жизни.

  21 мая 2010 года, обычный homo sapiens с планеты Земля - Крейг Вентер, стал Творцом. Сотворил он ни много - ни мало, а первый в истории человечества синтетический живой организм. Кроме самого  Вентера, в таинстве сотворения жизни принимал участие обычный компьютер.
Craig-Venter1
Крейг Вентер за работой.


Конечно событие такого "мелкого" масштаба совершенно неинтересно ни официальным СМИ, ни  ЖЖ.  Да и опасно теперь, после принятия закона об оскорблении пустых черепных коробок, такие темы затрагивать, вероятно.

Логично было предположить, что после такого акта творения, практически все религиозные  конфессии должны были организованным строем уйти в царство трёхбуквенное. Но это если пользоваться логикой. В реале же всё с точностью до наоборот. Изо всех учебных заведений, начиная с детских и заканчивая универами, торчат рясы, и тьма необразованности  уже практически затянула свет Знаний. Свет науки. Действительно эпоха превалирования пиара над разумом.



http://kinomix.tv/13208-sozdanie-sinteticheskoy-zhizni-creating-synthetic-life.html


Человек за семь лет создал другую жизнь. Кем же стал человек после этого? Тем кем  всегда и был - Творцом. ИМХО.


скачать фильм Creating Synthetic Life
http://rutracker.org/forum/viewtopic.php?t=3012768
donmigel_62: (кот - учёный)
BBC: Играя роль Бога / BBC. Horizon Playing God (2012) [HD 720p онлайн]

Синтетическая биология- наука, позволяющая разложить природу на составные части и собрать из них новые формы. Уже существуют дрожжи, при брожении которых образуется не спирт, а дизельное топливо. Производители обещают довести его выработку до 1 миллиона тонн в год и решить проблему энергетического кризиса. Коза - паук, созданная американскими учеными дает не совсем обычное молоко. Из него получается волокно, превосходящее по прочности кевлар и другие материалы. Создатели утверждают, что его можно будет применять в медицине для восстановления связок и сухожилий после травм. Создавая новые формы жизни и изменяя существующие, человек берет на себя роль Бога. Но этично ли это, и насколько это безопасно?

Profile

donmigel_62: (Default)
donmigel_62

March 2014

S M T W T F S
       1
2 3 4 5 6 7 8
9 10 11 12 13 14 15
16 17 1819202122
23242526272829
3031     

Syndicate

RSS Atom

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags