donmigel_62: (кот - учёный)

Оптогенетика заиграла новыми красками

Для оптогенетики нашли два новых светочувствительных белка, посредством которых можно одновременно управлять разными нейронами — с помощью красного и синего света.
Львиную долю того, что мы знаем сегодня о нейронах и нейронных цепях, мы знаем благодаря оптогенетическим методам. Последние основаны на введении в мембрану нейронов фоточувствительного белка опсина, который под действием света открывает трансмембранный ионный канал: поток ионов изменяет поляризацию мембраны, нейрон возбуждается и отправляет импульс своим соседям. Или наоборот: поток ионов успокаивает нейрон и сводит на нет всякую активность. Опсин вводится в ДНК нейронов вместе с флюоресцирующим белком, чтобы можно было отличить нейроны с фотосистемой от прочих.

С помощью оптогенетики можно подчинить себе целую группу клеток, активировать и подавлять их по своему усмотрению и наблюдать, что при этом произойдёт в мозге. Однако до сих пор за один раз можно было управлять только одной популяцией нейронов: все они получали одинаковый опсин и тут же реагировали на свет из введённого в мозг электрода.

Оптогенетические нейроны, подчиняющиеся красному или бледно-синему свету (фото Yasunobu Murata / McGovern Institute).

Но что будет, если использовать не один опсин, а два, настроенные на разные световые волны? Тогда удастся независимо оперировать сразу двумя группами нейронов, наблюдать, как они влияют друг на друга, на мозг и т. д. Словом, возможности расширяются многократно.


Именно это попытались сделать Эдуард Бойден (Edward S Boyden) и его коллеги из Массачусетского технологического института (США). Вместе с коллегами из Альбертского университета (Канада) они проанализировали 1 000 транскриптомов (полных наборов РНК, которыми обычно пользуется клетка) растений и водорослей. Опсину подошёл бы не всякий, а только тот, что совместим с нейронами млекопитающих, и таких в итоге нашлось два: один активировался в бледно-синем свете и был назван Chronos, а другой работал в красном диапазоне при длине волны 735 нм и был назван Chrimson.

В журнале Nature Methods авторы сообщают, что «синий» опсин, во-первых, срабатывал чрезвычайно быстро, а во-вторых, ему было достаточно совсем немного света, так что при совместном использовании двух белков можно было не опасаться, что Chrimson возбудится от избытка синего света, предназначенного для Chronos. С помощью двойной системы опсинов можно даже разложить одну нервную цепочку на две части, чтобы узнать, как одни нейроны влияют на другие, притом что и те и те заняты одним делом.

Преимущества двухканальной оптогенетической системы настолько очевидны, что может возникнуть вопрос, почему до сих пор такой метод нельзя было создать генетико-инженерными модификациями уже имеющихся у исследователей белков. Такие попытки, впрочем, предпринимались, но всякий раз учёным приходилось выбирать: либо белок будет работать быстро, но с интенсивным светом, либо медленно, но с более слабым освещением. Сделать так, чтобы белок действовал быстро и не требовал избытка света, никак не получалось, поэтому можно сказать, что исследователям действительно повезло найти естественный белок, удовлетворяющий всем требованиям.

Подготовлено по материалам MIT News. Изображение на заставке принадлежит Shutterstock.
donmigel_62: (кот - учёный)

"Генетические паразиты" в клетках мозга являются причиной шизофрении


Шизофрения возникает из-за повышенной активности в мозге ретротранспозонов — «генетических паразитов», которые нарушают нормальную работу генов, отвечающих за передачу сигналов между нервными клетками, говорится в статье, опубликованной в журнале Neuron.



«Наши результаты показывают, что ненормально высокая активность ретротранспозонов LINE-1 в нейронах, которую "запускают» влияние окружающей среды или генетические факторы, играет ключевую роль при развитии шизофрении", — пишут Казуя Ивамото (Kazuya Iwamoto) из университета Токио (Япония) и его коллеги.



Транспозонами называют небольшие фрагменты молекулы ДНК, которые способны копировать сами себя и встраивать новые копии в разные участки генома. При этом они не кодируют никаких полезных для организма белков и их иногда называют «генетическими паразитами».

Однако это не значит, что для организма транспозоны совершенно бесполезны, ученые считают, что они делают геном более изменчивым и помогают организму приспосабливаться к окружающей среде.

Платой за это являются различные болезни. Так, недавно была показана связь активности транспозонов LINE-1 с развитием раковых заболеваний у человека.

Ивамото и его коллеги расшифровали геномы клеток мозга умерших людей, страдавших при жизни шизофренией, и обнаружили там ненормально большое количество копий транспозона LINE-1. Они выяснили, что LINE-1 встраивается в гены, отвечающие за работу синапсов нейронов, которые дают нервным клеткам возможность обмениваться сигналами.

Ранее считалось, что в шизофрении «виновата» в основном наследственная предрасположенность к заболеванию. Однако теперь ученые показали в опытах на мышах и макаках, что к повышенному уровню LINE-1 в нейронах приводит также влияние факторов окружающей среды в раннем возрасте.

donmigel_62: (кот - учёный)

Ученые нашли ген, заставляющий ткани восстанавливаться, как в юности


Ученые обнаружили ген, активация которого заставляет ткани взрослых мышей восстанавливаться так же быстро, как у молодых животных; свои результаты они опубликовали в статье в журнале Cell.



«Звучит как научная фантастика, но (ген) Lin28a может быть частью целебного коктейля, придающего тканям взрослых исключительные способности к восстановлению, которые наблюдаются у молодых животных», — пояснил Джордж Дэли (George Daley) из Детской больницы Бостона (США).


Известно, что ткани восстанавливаются намного быстрее в молодости, нежели во взрослом возрасте. Это верно для многих животных — от насекомых до млекопитающих. Молекулярные механизмы, влияющие на способность тканей к восстановлению, до сих пор оставались неизвестными.

Дэли и его коллеги предположили, что важную роль в этом процессе может играть белок, кодируемый геном Lin28a. Этот ген активен на стадии эмбрионального развития, однако с возрастом уровни белка, который он кодирует, в организме падают. Ученые искусственно активировали Lin28a у взрослых мышей.

Они обнаружили, что это стимулировало размножение и миграцию клеток, поэтому у мышей быстрее отрастала сбритая шерсть, а также легче восстанавливалась хрящевая, костная и соединительная ткани при ранениях ушей и пальцев.

Исследователи обнаружили, что Lin28a оказывал свое благотворное действие из-за стимуляции клеточного дыхания — процессов переработки питательных веществ и кислорода, поступающих в клетку, в универсальные молекулы аденозинтрифосфата (АТФ), которые служат источником энергии для подавляющего большинства биохимических реакций.

Авторы статьи полагают, что

их результаты могут помочь в создании препаратов, способствующих восстановлению тканей у людей.

donmigel_62: (кот - учёный)

6 ФАКТОВ О ГЕНАХ ДОЛГОЛЕТИЯ




12 лет назад, в конце августа 2001 года, ученые из Гарвардского университета объявили о частичной разгадке «механики» долгожительства. Проведенный ими анализ генетического материала братьев и сестер, перешагнувших рубеж в 90 и 100 лет, показал, что по крайней мере один, а возможно и до 10 генов, расположенных в четвертой хромосоме, ответственны за то, что их обладатели живут гораздо дольше других. Предлагаем вашему вниманию 6 фактов, связанных с этим открытием.




Профессор Томас Перлз � ��
Профессор Томас Перлз  

1. Профессор Томас Перлз из Гарварда вместе с израильскими коллегами анализировал геномы 308 человек (пар, троен и т.д.) братьев и сестер в возрасте от 90 лет, то есть перешагнувших более чем на 20 лет возраст средней продолжительности жизни.

2. В одной из семей, ставшей участницей исследования, 8 из 10 родных братьев и сестер жили 90 и более лет. Существовал всего 1 шанс из 110 триллионов, что это произойдет.

3. Особое внимание исследователей привлек сегмент четвертой хромосомы длиной в 100–500 генов. Сравнительный анализ показал, что по крайней мере от одного до десяти генов в этом сегменте отвечали за долголетие.

4. Ученые назвали эти находки «генетическими ракетоносителями», поскольку гены долголетия помогали долгожителям избегать рака, болезней сердца, ухудшения когнитивных способностей с возрастом, остеопороза – то есть «быть выше всего этого».

5. Открытие дало импульс к дальнейшему изучению факторов долголетия на генетическом уровне. Ученые смогли сосредоточиться на поиске «дефективных» генов, приводящих к возрастным заболеваниям, таким, как болезнь Альцгеймера, рак, инсульт и диабет.

6. В сообщении о своем открытии Томас Перлз и его коллеги напомнили, что хорошая генетика – это только возможность, а не гарантия прожить долго. В пример было приведено масштабное датское исследование факторов продолжительности жизни близнецов, вышедшее в 1993 году. Оно показало, что на 30% количество прожитых лет зависит от генетики и на 70% – от образа жизни. То есть при одинаково «крепких» генах, как правило, дольше жили те братья и сестры, которые не курили и не злоупотребляли спиртным.

donmigel_62: (кот - учёный)

Генетическое конструирование развивается быстрее электроники.

Фото: Science

Уже через несколько лет получить живой организм с заданными свойствами можно будет также просто, как сегодня сделать покупку в магазине приложений. Причем свойства этих организмов будут совершенно необычными, несвойственными живой природе.

Целый ряд стартапов уже работает над тем, чтобы в ближайшем будущем создание новых форм жизни проходило так же просто, как создание цифрового изображения, распечатанного на принтере. И это будущее, в котором ДНК можно будет проектировать на компьютере и отправлять в печать в специальную биоустановку, уже не за горами.

Компания Genome Compiler, название которой — «Компилятор генома» — говорит само за себя, основана выпускником Стэнфорда Омри Амирав-Дрори (Omri Amirav-Drory). Предприятие занимается разработкой методики конструирования ДНК. Фирма получила первичное финансирование на Кикстартере, однако теперь ей помогают такие гиганты, как Autodesk.

«Мы демократизируем акт творения, — говорит Омри, рассказывая о миссии своей компании. — ДНК является просто разновидностью кода, в котором можно сделать исправления так же, как это можно сделать в обычном программном коде». Глава компании добавляет, что суть методики заключается в использовании фрагментов ДНК растений и животных в качестве элементов конструктора, из которых можно создать новые организмы.

Омри допускает, что в будущем можно будет создать что-то вроде магазина приложений, в котором любой желающий может скачать код для создания необходимого живого организма. Причем, эти организмы cмогут обладать свойствами, которые не присущи организмам естественного происхождения.



Но нужную последовательность генов мало смоделировать. Нужно еще собрать ее, или хотя бы уметь внести в существующий геном требуемые изменения. Для этого ученые продолжают работать над совершенствованием старых методов, таких как полимеразная цепная реакция (реплицирование ДНК), а также работать над новыми методиками, такими как лазерное катапультирование.

Но даже самих ученых поражает скорость, с которой развиваются биоинженерные технологии. «Секвенирование генома человека завершилось 10 лет назад, — рассказывает Омри, — оно обошлось в $3 миллиарда и заняло 15 лет. Теперь это можно сделать за несколько тысяч долларов и один день». Ученый привел пример, как за пару лет стоимость реплицирования пары ДНК снизилась с $2 до $0,25, пояснив, что биоинженерия развивается намного стремительнее микроэлектроники. Просто обычным людям прогресс в этой области не настолько очевиден.

http://www.genomecompiler.com/

donmigel_62: (кот - учёный)

Быстрая и простая генная инженерия: можно изменить ДНК за 1 шаг

В издании ACS Synthetic Biology опубликовали новость об эксперименте, который открывает новый простой путь для создания искусственных и генно-модифицированных организмов.

Новая технология, названная clonetegration, позволяет проводить модификацию ДНК за один прием, что облегчает и ускоряет работу генного инженера.


Принцип работы технологии clonetegration

Интеграция куска ДНК в геном бактерии является главным инструментом генной инженерии, которая изготавливает специальных бактерий для различного применения, например выработки биотоплива из отходов или очистки разливов нефти. К сожалению, современные методы генной инженерии очень трудоемкие, включают много этапов, да к тому же имеют множество ограничений в плане возможностей «переделки» организмов и тем более создания новых. Для устранения этих проблем, группа исследователей во главе с Китом Шервином разработала новую технологию clonetegration, которая основана на клонировании генов или фрагментов ДНК.

Новая технология позволяет внедрять фрагменты ДНК всего лишь за один шаг, что выгодно отличает ее от любых других современных методик. В ходе лабораторных испытаний технологии clonetegration, ученые осуществляли успешнее модификации бактерий E.coli и Salmonella Typhimurium, которые широко используются в биотехнологиях. Новый метод генной инженерии очень быстр, эффективен и позволяет интегрировать в геном несколько генов одновременно, что позволяет эффективно создавать синтетические биологические системы.

donmigel_62: (кот - учёный)

Новые генетически спроектированные бактерии вырабатывают биотопливо, идентичное по составу бензину


Группа ученых из университета Эксетера, возглавляемая Джоном Лав (John Love), взяв необходимый генетический материал из камфорного дерева, почвенных микроорганизмов и сине-зеленых водорослей, внедрили этот материал в ДНК известных бактерий кишечной палочки (Escherichia coli). В итоге данные бактерии, питаясь глюкозой, выделяют ферменты, которые заставляют сахар превращаться в жирные кислоты и, затем, в углеводороды, которые с химической и структурной точки зрения идентичны углеводородам в топливе, полученном перегонкой нефти (кракто об этом  уже писали).

Несмотря на огромные перспективы использования биотоплива в качестве альтернативы топливу, производимому из ископаемых ресурсов, до последнего времени людям не удалось добиться в этом деле более-менее значительного прогресса. К сожалению, получающееся биотопливо можно использовать только в качестве добавок к обычному дизельному топливу, авиационному керосину и в редких случаях к бензину.

Такая ситуация складывается из-за того, что вырабатываемое бактериями топливо состоит из углеводородных цепочек «неправильной» формы и размеров, существенно отличающихся от цепочек углеводородов нормального бензина и дизельного топлива.

Это делает процесс сгорания биотоплива крайне неэффективным, а его высокая химическая активность становится причиной повышенной коррозии некоторых деталей двигателей внутреннего сгорания.

Для того, чтобы начать серьезно рассматривать биотопливо в качестве замены обычным видам топлива, требуется переделка конструкции двигателей или дополнительная энергоемкая и дорогостоящая стадия обработки биотоплива, в ходе которой углеводородные цепочки будут приведены к их «нормальной» форме.

Для того, чтобы избежать столь кардинальных перемен или дополнительных затрат, группа ученых из университета Эксетера, возглавляемая Джоном Лав (John Love), взяв необходимый генетический материал из камфорного дерева, почвенных микроорганизмов и сине-зеленых водорослей, внедрили этот материал в ДНК известных бактерий кишечной палочки (Escherichia coli).

ExpandRead more... )
donmigel_62: (кот - учёный)

"Ключ к бессмертию" в деталях: составлена карта

Ученые из университета Копенгагена в сотрудничестве с международной исследовательской группой впервые составили детальную карту структуры теломеразы. Этот фермент считается основным инструментом омоложения клеток и обещает победу над старостью, а может и смертью.

Карта структуры теломеразы должна помочь понять механизмы деятельности данного фермента и создать лекарства от старческих заболеваний и рака.

ExpandRead more... )
donmigel_62: (кот - учёный)

ОМОЛОЖЕНИЕ МОЗГА: ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПЕРЕКЛЮЧАТЕЛЬ


Свойственная молодому мозгу пластичность, позволяющая легко овладевать иностранными языками и быстрее восстанавливаться после травм, утрачивается с годами. Но вернуть мозг в юное состояние можно, воздействуя всего на один ген, обнаружили ученые.

Нейрон, дендриты которого усеяны дендритными шипиками, способными образовывать синаптические связи с другими нейронами.
Нейрон, дендриты которого усеяны дендритными шипиками, способными образовывать синаптические связи с другими нейронами.
Нейроны соматосенсорной коры (трехмерная реконструкция)
Нейроны соматосенсорной коры (трехмерная реконструкция)
Наблюдая за синапсами в мозге подопытных мышей в течение нескольких недель и даже месяцев, исследователи из медицинской школы Йельского университета выявили единственный ген, замедляющий формирование синаптических связей между нейронами - Nogo-рецептор-1. Мыши без этого гена сохраняли свойственную юным особям пластичность мозга вплоть до преклонного возраста. Заблокировав функцию Nogo-рецептора-1 у взрослых мышей, ученые отметили возвращение к подростковому уровню пластичности.
В ходе реабилитации после травм головного мозга пациенты порой вынуждены заново осваивать простейшие навыки - например, движение руками. Взрослые мыши, лишенные Nogo-рецептора-1, продемонстрировали такую же способность к восстановлению после повреждения мозга, как и молодые особи. Вероятно, однажды медики смогут, манипулируя этим геном, ускорить реабилитацию и людей с подобными травмами. Также было показано, что мыши без Nogo-рецепторов быстрее избавляются от тяжелых воспоминаний, что открывает перспективы в лечении посттравматического стрессового расстройства.
источник  YaleNews

Profile

donmigel_62: (Default)
donmigel_62

March 2014

S M T W T F S
       1
2 3 4 5 6 7 8
9 10 11 12 13 14 15
16 17 1819202122
23242526272829
3031     

Syndicate

RSS Atom

Style Credit

Expand Cut Tags

Expand All Cut TagsCollapse All Cut Tags